第九章第二集.连坐

文中文献：1. 图为不断延伸的演员关系网，关系网中的演员间的联系是他们共同参演的电影。图中每个演员通过最多两步即可与凯文·贝肯建立起联系。2. 图为遗传学之父格雷戈尔·孟德尔以及其豌豆实验。孟德尔发现，在只能长出黄色（图中浅灰色）或绿色（图中暗灰色）豌豆种子的异花授粉杂交植株中，第一代杂交后代只产出了黄色种子。然而，接下来的一代所产出的黄色种子数和绿色种子数的比率为 3： 1。

文中文献：1. 图为不断延伸的演员关系网，关系网中的演员间的联系是他们共同参演的电影。图中每个演员通过最多两步即可与凯文·贝肯建立起联系。 2. 图为遗传学之父格雷戈尔·孟德尔以及其豌豆实验。孟德尔发现，在只能长出黄色（图中浅灰色）或绿色（图中暗灰色）豌豆种子的异花授粉杂交植株中，第一代杂交后代只产出了黄色种子。然而，接下来的一代所产出的黄色种子数和绿色种子数的比率为 3： 1。

第九章第一集.复杂社会中的随性基因

第八章第五集.超越基因

第八章第四集.非洲的基因宝库

文中文献：1. 图为果蝇实验。顶排的实验显示：经过几代之后，白眼果蝇在果蝇种群中不复存在。下面一排的另一实验显示了与上面相反的情况。2. 图为某基因的中新等位基因的兴衰。箭头指示时间先后。如果画一条与时间轴垂直的线条，那么每一条这样的垂线都显示了某一时刻该基因的等位基因分布。一开始， 100%的细菌带有黑色标示的等位基因。每个颜色区域的最左侧尖端表示由突变导致的新等位基因的出现。大部分等位基因会很快消失，但有时新等位基因会一跃升到基因社会中的支配地位，而使先前的等位基因衰落下去。

文中文献：1.  图为果蝇实验。顶排的实验显示：经过几代之后，白眼果蝇在果蝇种群中不复存在。下面一排的另一实验显示了与上面相反的情况。 2. 图为某基因的中新等位基因的兴衰。箭头指示时间先后。如果画一条与时间轴垂直的线条，那么每一条这样的垂线都显示了某一时刻该基因的等位基因分布。一开始， 100%的细菌带有黑色标示的等位基因。每个颜色区域的最左侧尖端表示由突变导致的新等位基因的出现。大部分等位基因会很快消失，但有时新等位基因会一跃升到基因社会中的支配地位，而使先前的等位基因衰落下去。

第八章第三集.幸运基因

文中文献：1. 图为全球紫外线辐射水平和各地原住民肤色。在地球上大部分地区，使人们拥有当地适宜肤色的等位基因在基因社会中占据优势。中美洲和南美洲地区则有例外：肤色较浅的人们在距今不到两万年前才在这些地区定居，自然选择可能还需要更多时间才能让这些人口拥有更适宜且更深的肤色。

文中文献：1.  图为全球紫外线辐射水平和各地原住民肤色。在地球上大部分地区，使人们拥有当地适宜肤色的等位基因在基因社会中占据优势。中美洲和南美洲地区则有例外：肤色较浅的人们在距今不到两万年前才在这些地区定居，自然选择可能还需要更多时间才能让这些人口拥有更适宜且更深的肤色。

第八章第二集.尝得到、看得见的演化

第八章第一集.克林顿悖论

第七章第五集.性的基因组战争

第七章第四集.这和你无关

文中文献：1. 图为精子生产过程中的自然选择的示例。新突变（灰色圆圈）会增加精子生产过程中的细胞增殖速度，保证该突变对应的等位基因比其他等位基因遗传到更多的精子中。2. 图为毒药/解药自私基因对。基因组中携带该基因对的精子细胞能够生产有毒蛋白质及其解药。只有毒药会转移到细胞外，杀死所有无法生产解药的邻近精子细胞。

文中文献：1. 图为精子生产过程中的自然选择的示例。新突变（灰色圆圈）会增加精子生产过程中的细胞增殖速度，保证该突变对应的等位基因比其他等位基因遗传到更多的精子中。 2. 图为毒药/解药自私基因对。基因组中携带该基因对的精子细胞能够生产有毒蛋白质及其解药。只有毒药会转移到细胞外，杀死所有无法生产解药的邻近精子细胞。

第七章第三集.豪赌和大老千

各种值得深思的有趣又奇葩的人体冷知识第一章 疯狂的进化：从猿类到智人，拢共分几步？第二章 怪诞的脑科学：大脑的“正确打开方式”第三章 神秘的人体：万万没想到的人体冷知识第四章 古怪的心理：聊聊心理那点事儿兴趣爱好庞杂的英语老师，陪你从不同方面带你领略自身的奥秘，发掘不一样的自我~

文中文献：1. 在复制完成后，为了能进行重组，来自父方和母方的染色体拷贝各有两个相连的染色体拷贝。这两对染色体会彼此交换相匹配的区域来进行重组。2. 人们一直认为，有一种动物——蛭形轮虫（ bdelloid rotifers），凭借无性生殖的全雌性生活方式生存了数百万年。如今我们知道了，从基因社会的角度来看，这些雌性动物并非仅仅进行着无性生殖。它们利用了类似细菌用到的基因组混合策略。

文中文献：1. 在复制完成后，为了能进行重组，来自父方和母方的染色体拷贝各有两个相连的染色体拷贝。这两对染色体会彼此交换相匹配的区域来进行重组。 2. 人们一直认为，有一种动物——蛭形轮虫（ bdelloid rotifers），凭借无性生殖的全雌性生活方式生存了数百万年。如今我们知道了，从基因社会的角度来看，这些雌性动物并非仅仅进行着无性生殖。它们利用了类似细菌用到的基因组混合策略。

第七章第二集.公平的性

文中文献：1. 图为哈佛医学院的罗伊·基松尼（ Roy Kishony）和其同事们所进行的实验。将装满糖溶液的长方形大培养皿像橄榄球场上的码线那样划分成几个部分。本图中所显示的是培养皿“橄榄球场”的一半，从图中顶部的底线区开始，在图中底部的 50码线处结束。顶部的底线区里没有抗生素，而在 0码线到 10码线中间的区域有浓度较低的抗生素。在 10码线外、 20码线外、 30码线外、 40码线外的区域（从上至下），抗生素浓度依次增加十倍。当细菌薄薄地覆盖了整个区域后，它们会一波波地增殖：首先覆盖到球门线，再覆盖到 10码线，之后照此继续。细菌每跨过一条线都需要进行额外的突变，而当经历前次突变的细菌足够多时，才能进行下一次额外突变。2. 细菌基因社会理论上的演化情况。这里我们重点讨论两个基因，这两个基因有两种可能的等位基因：适合度较低的等位基因（ a和 b）和适合度较高的等位基因（ A和 B）。箭头表示时间先后。如果画一条与时间轴垂直的线条，那么每一条这样的垂线都显示了等位基因在那某一时刻的分布。一开始，所有细菌携带的都是适合度较低的等位基因 a和 b。之后，适合度较高的等位基因 A和 B独立演化出来，在 Ab和 aB个体中与等位基因 a和 b共存了一段时间。但由于细菌里没有有性生殖和重组，这两个突变无法并入同一基因组中，因此 aB组合遭到了 Ab组合的排挤。很长一段时间后， B突变在某 Ab个体中再次发生，由此终于产生了将两种有益突变相结合的细菌。

文中文献：1. 图为哈佛医学院的罗伊·基松尼（ Roy Kishony）和其同事们所进行的实验。将装满糖溶液的长方形大培养皿像橄榄球场上的码线那样划分成几个部分。本图中所显示的是培养皿“橄榄球场”的一半，从图中顶部的底线区开始，在图中底部的 50码线处结束。顶部的底线区里没有抗生素，而在 0码线到 10码线中间的区域有浓度较低的抗生素。在 10码线外、 20码线外、 30码线外、 40码线外的区域（从上至下），抗生素浓度依次增加十倍。当细菌薄薄地覆盖了整个区域后，它们会一波波地增殖：首先覆盖到球门线，再覆盖到 10码线，之后照此继续。细菌每跨过一条线都需要进行额外的突变，而当经历前次突变的细菌足够多时，才能进行下一次额外突变。 2. 细菌基因社会理论上的演化情况。这里我们重点讨论两个基因，这两个基因有两种可能的等位基因：适合度较低的等位基因（ a和 b）和适合度较高的等位基因（ A和 B）。箭头表示时间先后。如果画一条与时间轴垂直的线条，那么每一条这样的垂线都显示了等位基因在那某一时刻的分布。一开始，所有细菌携带的都是适合度较低的等位基因 a和 b。之后，适合度较高的等位基因 A和 B独立演化出来，在 Ab和 aB个体中与等位基因 a和 b共存了一段时间。但由于细菌里没有有性生殖和重组，这两个突变无法并入同一基因组中，因此 aB组合遭到了 Ab组合的排挤。很长一段时间后， B突变在某 Ab个体中再次发生，由此终于产生了将两种有益突变相结合的细菌。

第七章第一集.性有何用？

文中文献：1. 根据达尔文的理论，演化过程是由随机变异和自然选择促成的。如果出现了影响脖子长度的可遗传变异，那么较高的长颈鹿则会找到更多食物，因此也更易存活下来——因此也会留下更多遗传其长脖子的后代。而根据拉马克的理论，长颈鹿不断伸长脖子以觅食更高处的树叶，因此在其一生中脖子不断拉长，而其后代也继承了这些拉长了的脖子。

文中文献：1. 根据达尔文的理论，演化过程是由随机变异和自然选择促成的。如果出现了影响脖子长度的可遗传变异，那么较高的长颈鹿则会找到更多食物，因此也更易存活下来——因此也会留下更多遗传其长脖子的后代。而根据拉马克的理论，长颈鹿不断伸长脖子以觅食更高处的树叶，因此在其一生中脖子不断拉长，而其后代也继承了这些拉长了的脖子。

第六章第五集.双面间谍和长颈鹿宝宝

文中文献：1.图为 B细胞的演化过程。 B细胞利用其表面的抗体搜捕入侵者。自然会选择与入侵者的部分结合能力最强的 B细胞，使其不断复制。

文中文献：1.图为 B细胞的演化过程。 B细胞利用其表面的抗体搜捕入侵者。自然会选择与入侵者的部分结合能力最强的 B细胞，使其不断复制。

第六章第四集.达尔文会怎么做

文中文献：1. 图为功能多种多样的蛋白质。某些蛋白质可能会催化化学反应，在这个过程中，该蛋白质促使两种特定分子嵌入到蛋白质上凹槽里（图右上），从而相互彼此结合。另一种蛋白质则可能会通过传递高能化学基团来传递信息（图右中）。第三种蛋白质则可能会参与由同一类蛋白质组成的聚合物以形成微小的支撑梁，帮助支撑细胞结构（图右下）。2.生物学的“中心法则”：聚合酶将 DNA复制（转录）到信使 RNA中，而后核糖体将信使 RNA翻译成蛋白质。那些类似小喇叭的图形被称为转运 RNA，它们将相匹配的氨基酸运送到核糖体中。3. 在 VDJ系统中，不同基因部分的多种版本（图中的卡片）组合成了多种多样的抗体。2. 

文中文献：1. 图为功能多种多样的蛋白质。某些蛋白质可能会催化化学反应，在这个过程中，该蛋白质促使两种特定分子嵌入到蛋白质上凹槽里（图右上），从而相互彼此结合。另一种蛋白质则可能会通过传递高能化学基团来传递信息（图右中）。第三种蛋白质则可能会参与由同一类蛋白质组成的聚合物以形成微小的支撑梁，帮助支撑细胞结构（图右下）。 2.生物学的“中心法则”：聚合酶将 DNA复制（转录）到信使 RNA中，而后核糖体将信使 RNA翻译成蛋白质。那些类似小喇叭的图形被称为转运 RNA，它们将相匹配的氨基酸运送到核糖体中。 3. 在 VDJ系统中，不同基因部分的多种版本（图中的卡片）组合成了多种多样的抗体。 2.

第六章第三集.随机档案照生成器

文中文献：1. 图为病毒的生命周期。病毒黏附到某细胞上，并将其自身基因组注入细胞。病毒基因组会引导细胞复制病毒。一旦有大量病毒形成，细胞就会破裂并释放出病毒。2. 就像保安将嫌疑人与一系列档案照片进行比对一样，细菌会将潜在侵入者的基因组与过去侵入者的基因组进行比对。而过去侵入者的档案全部存放在细菌 CRISPR（成簇的规律性间隔短回文重复序列）的间隔区中。3. 图为某细菌在病毒性感染前与感染后的 CRISPR区域。图中，病毒攻击一个细菌种群，除某一细菌幸免外其余细菌全部死亡。幸存的细菌成功将与病毒基因组中某部分的互补的 DNA整合进了自己的 CRISPR区域。这种整合使得细菌有了摧毁该病毒 DNA的能力，并对该病毒有了免疫作用。幸存细菌的后代会遗传这种免疫力并茁壮生长。4. 图为细菌免疫系统将已储存为 CRISPR间隔区的档案照片复制到单链 RNA分子中。之后，这些单链 RNA分子会受任何与其互补的病毒基因组序列的吸引。这里应用到的化学作用力也同样存在于我们的染色体中，使得染色体内的 DNA双链彼此结合。

文中文献：1. 图为病毒的生命周期。病毒黏附到某细胞上，并将其自身基因组注入细胞。病毒基因组会引导细胞复制病毒。一旦有大量病毒形成，细胞就会破裂并释放出病毒。 2. 就像保安将嫌疑人与一系列档案照片进行比对一样，细菌会将潜在侵入者的基因组与过去侵入者的基因组进行比对。而过去侵入者的档案全部存放在细菌 CRISPR（成簇的规律性间隔短回文重复序列）的间隔区中。 3. 图为某细菌在病毒性感染前与感染后的 CRISPR区域。图中，病毒攻击一个细菌种群，除某一细菌幸免外其余细菌全部死亡。幸存的细菌成功将与病毒基因组中某部分的互补的 DNA整合进了自己的 CRISPR区域。这种整合使得细菌有了摧毁该病毒 DNA的能力，并对该病毒有了免疫作用。幸存细菌的后代会遗传这种免疫力并茁壮生长。 4. 图为细菌免疫系统将已储存为 CRISPR间隔区的档案照片复制到单链 RNA分子中。之后，这些单链 RNA分子会受任何与其互补的病毒基因组序列的吸引。这里应用到的化学作用力也同样存在于我们的染色体中，使得染色体内的 DNA双链彼此结合。

第六章第二集.记仇的细菌

文中文献：1. https://mp.weixin.qq.com/s/uC6jdNYqVQ4zzXIj2cLSnA虽然这个冥想是龙华医院为了提高大家免疫力，更好地抗击疫情所用，但对失眠也是非常有用的，大家可以放心聆听。希望每个小可爱每天都有一份好睡眠~~收起

文中文献：1. <a href="https://mp.weixin.qq.com/s/uC6jdNYqVQ4zzXIj2cLSnA" rel="nofollow" target="_blank">https://mp.weixin.qq.com/s/uC6jdNYqVQ4zzXIj2cLSnA</a>虽然这个冥想是龙华医院为了提高大家免疫力，更好地抗击疫情所用，但对失眠也是非常有用的，大家可以放心聆听。希望每个小可爱每天都有一份好睡眠~~ 收起

【给焦虑+失眠小伙伴的特辑】素老师和她的干货陪你们挑战这俩调皮的黏人精

文中文献：1. 图为基因社会的类比。左侧为不同购物中心中的三排商铺。每列商店代表了零售业中的一类商家：眼镜店、书店、鞋店和糕饼店。有些商店，比如鲍勃鞋店，数量比其他商店更多，因此这种商店要更为成功。左侧饼形图显示的是不同糕饼店的整体市场份额。右侧为三排人类等位基因，每一排都来自不同的人体基因组。每个方块代表一个等位基因，不同等位基因间的差异来源于每个等位基因特有的基因突变。同一列里的等位基因都属于同一个基因。某些等位基因，例如最右侧基因中的 A等位基因，要比其他等位基因更为成功。右侧饼形图显示的是图中最左侧基因中的三个等位基因在所有人类基因组中所出现的相对频率。

文中文献：1. 图为基因社会的类比。左侧为不同购物中心中的三排商铺。每列商店代表了零售业中的一类商家：眼镜店、书店、鞋店和糕饼店。有些商店，比如鲍勃鞋店，数量比其他商店更多，因此这种商店要更为成功。左侧饼形图显示的是不同糕饼店的整体市场份额。右侧为三排人类等位基因，每一排都来自不同的人体基因组。每个方块代表一个等位基因，不同等位基因间的差异来源于每个等位基因特有的基因突变。同一列里的等位基因都属于同一个基因。某些等位基因，例如最右侧基因中的 A等位基因，要比其他等位基因更为成功。右侧饼形图显示的是图中最左侧基因中的三个等位基因在所有人类基因组中所出现的相对频率。

第六章第一集.基因是愿意合作的利己主义者

注释：1. 本集中的裸滨鼠案例在《基因与社会》英文版出版后被推翻。 2016年 2月，《兽医病理学》杂志上发表的一篇论文首次报告了裸滨鼠罹患癌症的病例。但与其他动物及人类相比，裸滨鼠罹患癌症的概率极低依然是不争的事实。

注释：1. 本集中的裸滨鼠案例在《基因与社会》英文版出版后被推翻。 2016年 2月，《兽医病理学》杂志上发表的一篇论文首次报告了裸滨鼠罹患癌症的病例。但与其他动物及人类相比，裸滨鼠罹患癌症的概率极低依然是不争的事实。

第五章第五集.也说基因+基因突变，有坏也有好

文中文献：1. 图为癌症逐步发展的方式，按时间顺序从顶部（该细胞系的首个祖细胞）至底部（当前存活的所有后代细胞）。每个箭头代表某种使其携带者分裂速度快于其他细胞的基因突变（在该突变下的分支中可见较快的后代繁殖速度）。随着时间的推移，该分裂速度较快的细胞会产生非常多的后代，其数目足以使新突变的出现成为可能。新突变将进一步加快细胞增殖的速度，如此周而复始，直到某一细胞完成了所有所需的步骤，发展成为熟的癌症。

文中文献：1. 图为癌症逐步发展的方式，按时间顺序从顶部（该细胞系的首个祖细胞）至底部（当前存活的所有后代细胞）。每个箭头代表某种使其携带者分裂速度快于其他细胞的基因突变（在该突变下的分支中可见较快的后代繁殖速度）。随着时间的推移，该分裂速度较快的细胞会产生非常多的后代，其数目足以使新突变的出现成为可能。新突变将进一步加快细胞增殖的速度，如此周而复始，直到某一细胞完成了所有所需的步骤，发展成为熟的癌症。

第五章第四集.叛变的基因组，555

各种值得深思的有趣又奇葩的人体冷知识第一章 疯狂的进化：从猿类到智人，拢共分几步？第二章 怪诞的脑科学：大脑的“正确打开方式”第三章 神秘的人体：万万没想到的人体冷知识第四章 古怪的心理：聊聊心理那点事儿兴趣爱好庞杂的英语老师，陪你从不同方面带你领略自身的奥秘，发掘不一样的自我~

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